Willie Boy raconte les aventures d’un jeune garçon du far West. Tout au long de la série, il est à la recherche de son père, Fernando, dont il a été séparé à la naissance pour finalement être élevé par une famille de brigands, les frères Wingate. Là où le dessin animé est intéressant, c’est qu’il soulève d’autres problématiques comme le racisme, auquel Willie Boy doit faire face puisqu'il est mi-indien, mi-japonais (mexicain dans la VF) ou encore le refus de la violence gratuite. Mais il ne plaisante pas non plus et ne se laisse pas faire car il manie le revolver avec dextérité et affronte les dangers les plus terribles de l’Ouest !