En 3567, la Terre est recouverte par une barrière appelée Olynssis, qui perturbe le temps et l'espace. Elle a été dressée par des Jardiniers : envahisseurs dont le but est de détruire l'espèce humaine.  Les Jardiniers sont en réalité des machines organiques qui, une fois détruites, peuvent être vendus en pièces détachées. Une caste de chasseurs a donc vu le jour. Tokito Aizawa, l'un de ces chasseurs, rencontre un jour une jeune fille nommé Téa, et sa machine nommé Silver. Téa appelle Tokito "Koichi", et lui demande de l'aide. Elle va bouleverser sa vie.